2022年初，突尼斯的一家病毒學實驗室收到了獸醫懷疑感染口蹄疫的奶牛的口腔樣本。口蹄疫是一種影響牛、豬和山羊等偶蹄動物的高度傳染性疾病，可導致動物和動物產品的地區和國際貿易中斷。該病的特征是發燒和蹄間、口腔、舌頭和嘴唇上出現水皰樣瘡。
突尼斯獸醫研究所病毒學實驗室的病毒學家Soufien Sghaier在將樣本提交給基因測序服務機構的幾天內，收到了有助于確認口蹄疫毒株正在傳播的結果。Sghaier得以通知獸醫當局實施控制措施，以防止疾病蔓延。對毒株的及時確認，由原子能機構與聯合國糧食及農業組織（糧農組織）合作完成。糧農組織為測序服務提供便利，并提供處理結果所需的培訓。
“我們很快收到了一例口蹄疫疑似病例的測序結果。樣本于周五被送往柏林的一家實驗室，我們于周一下午收到了測序結果。”Sghaier解釋說，“這使我們能夠在創紀錄的時間內進行分析，確定口蹄疫的具體毒株。到星期二，我們已將關于口蹄疫毒株的報告發送給獸醫當局。”為了選擇或開發有效的疫苗，需要對口蹄疫毒株進行鑒別。
基因測序對于確定一種流行疾病是地方性疾病還是外來輸入疾病非常重要。糧農組織/原子能機構糧農核技術聯合中心動物衛生官員Ivancho Naletoski說：“基因測序可幫助我們了解病原體（引起疾病的生物體）屬于哪個毒株，以及哪種疫苗對病原體有效。”根據基因測序，可以創建繪制物種譜系的系統發育樹。
“我們通過系統發育分析，確定我們已經有了一種可以保護我們牛群的疫苗。獸醫當局實施了周邊疫苗接種，以減少口蹄疫傳播的風險。”Sghaier說。周邊疫苗接種，或緩沖帶疫苗接種，有助于防止病毒傳播到其他地理區域。
